MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nostoc sp. PCC 7107 chromosome

Total Repeats: 128662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019676	AGC	2	6	14	19	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019676	AAT	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705466
3	NC_019676	ATT	2	6	163	168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427705466
4	NC_019676	GGT	2	6	283	288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427705466
5	NC_019676	CTG	2	6	317	322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427705466
6	NC_019676	A	6	6	365	370	100 %	0 %	0 %	0 %	427705466
7	NC_019676	TGG	2	6	419	424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427705466
8	NC_019676	GCA	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427705466
9	NC_019676	TG	3	6	503	508	0 %	50 %	50 %	0 %	427705466
10	NC_019676	GTG	3	9	506	514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427705466
11	NC_019676	GCAA	2	8	540	547	50 %	0 %	25 %	25 %	427705466
12	NC_019676	GCT	2	6	676	681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427705466
13	NC_019676	TGA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705466
14	NC_019676	AAG	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427705466
15	NC_019676	TACAT	2	10	759	768	40 %	40 %	0 %	20 %	427705466
16	NC_019676	CAAAT	2	10	809	818	60 %	20 %	0 %	20 %	427705466
17	NC_019676	AG	3	6	831	836	50 %	0 %	50 %	0 %	427705466
18	NC_019676	A	7	7	914	920	100 %	0 %	0 %	0 %	427705466
19	NC_019676	AG	3	6	947	952	50 %	0 %	50 %	0 %	427705466
20	NC_019676	AACT	2	8	972	979	50 %	25 %	0 %	25 %	427705466
21	NC_019676	GCT	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427705466
22	NC_019676	ACG	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427705466
23	NC_019676	AC	3	6	1236	1241	50 %	0 %	0 %	50 %	427705466
24	NC_019676	TGG	2	6	1275	1280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427705466
25	NC_019676	A	6	6	1313	1318	100 %	0 %	0 %	0 %	427705466
26	NC_019676	AAAG	2	8	1330	1337	75 %	0 %	25 %	0 %	427705466
27	NC_019676	ATC	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427705466
28	NC_019676	ACT	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019676	TTAAG	2	10	1489	1498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019676	A	6	6	1502	1507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019676	ATTAAA	2	12	1510	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019676	A	7	7	1533	1539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019676	TCA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019676	CAT	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019676	ATT	2	6	1683	1688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019676	A	6	6	1734	1739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019676	ATC	2	6	1886	1891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427705467
38	NC_019676	TTTGA	2	10	1954	1963	20 %	60 %	20 %	0 %	427705467
39	NC_019676	AGG	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427705467
40	NC_019676	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427705467
41	NC_019676	TGA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705467
42	NC_019676	CAAG	2	8	2286	2293	50 %	0 %	25 %	25 %	427705467
43	NC_019676	GTG	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427705467
44	NC_019676	CAT	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427705467
45	NC_019676	TGA	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705467
46	NC_019676	AGAA	2	8	2649	2656	75 %	0 %	25 %	0 %	427705467
47	NC_019676	AAT	2	6	2680	2685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705467
48	NC_019676	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019676	A	6	6	3003	3008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019676	TCT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427705468
51	NC_019676	GA	3	6	3107	3112	50 %	0 %	50 %	0 %	427705468
52	NC_019676	AAC	3	9	3173	3181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427705468
53	NC_019676	TCG	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427705468
54	NC_019676	GTT	3	9	3319	3327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427705468
55	NC_019676	CCA	2	6	3330	3335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427705468
56	NC_019676	TTC	2	6	3404	3409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427705468
57	NC_019676	AAATT	2	10	3486	3495	60 %	40 %	0 %	0 %	427705468
58	NC_019676	CTT	2	6	3514	3519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427705468
59	NC_019676	AAT	3	9	3569	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705468
60	NC_019676	TTC	2	6	3593	3598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427705468
61	NC_019676	ATA	2	6	3651	3656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705468
62	NC_019676	ACA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427705468
63	NC_019676	AAT	2	6	3740	3745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705468
64	NC_019676	GATT	2	8	3746	3753	25 %	50 %	25 %	0 %	427705468
65	NC_019676	TAT	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427705469
66	NC_019676	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	427705469
67	NC_019676	CAG	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427705469
68	NC_019676	ATTA	2	8	3936	3943	50 %	50 %	0 %	0 %	427705469
69	NC_019676	T	6	6	4083	4088	0 %	100 %	0 %	0 %	427705469
70	NC_019676	CCA	3	9	4210	4218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427705469
71	NC_019676	AGT	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705469
72	NC_019676	TTA	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427705469
73	NC_019676	GGA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427705469
74	NC_019676	TGT	2	6	4389	4394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427705469
75	NC_019676	TAC	2	6	4412	4417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427705469
76	NC_019676	T	7	7	4458	4464	0 %	100 %	0 %	0 %	427705469
77	NC_019676	GAA	2	6	4546	4551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427705469
78	NC_019676	ACG	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427705469
79	NC_019676	AGT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705469
80	NC_019676	AAT	2	6	4829	4834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705469
81	NC_019676	AAAT	2	8	4909	4916	75 %	25 %	0 %	0 %	427705470
82	NC_019676	AGAT	2	8	4956	4963	50 %	25 %	25 %	0 %	427705470
83	NC_019676	CTA	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427705470
84	NC_019676	ATA	2	6	5001	5006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705470
85	NC_019676	AGGA	2	8	5074	5081	50 %	0 %	50 %	0 %	427705470
86	NC_019676	TAA	2	6	5086	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705470
87	NC_019676	GCT	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427705470
88	NC_019676	TTGC	2	8	5151	5158	0 %	50 %	25 %	25 %	427705470
89	NC_019676	TAAA	2	8	5196	5203	75 %	25 %	0 %	0 %	427705470
90	NC_019676	TA	4	8	5323	5330	50 %	50 %	0 %	0 %	427705470
91	NC_019676	TAA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705470
92	NC_019676	TAG	2	6	5437	5442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705470
93	NC_019676	CCA	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427705470
94	NC_019676	ATA	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705470
95	NC_019676	GCCAA	2	10	5572	5581	40 %	0 %	20 %	40 %	427705470
96	NC_019676	TGTTAA	2	12	5587	5598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	427705470
97	NC_019676	AT	3	6	5619	5624	50 %	50 %	0 %	0 %	427705470
98	NC_019676	TAA	3	9	5653	5661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705470
99	NC_019676	ATAA	2	8	5665	5672	75 %	25 %	0 %	0 %	427705470
100	NC_019676	TTTG	2	8	5706	5713	0 %	75 %	25 %	0 %	427705470
101	NC_019676	ACA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427705470
102	NC_019676	AAATA	2	10	5740	5749	80 %	20 %	0 %	0 %	427705470
103	NC_019676	AAAATA	2	12	5889	5900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	427705470
104	NC_019676	TAGT	2	8	5913	5920	25 %	50 %	25 %	0 %	427705470
105	NC_019676	TGT	2	6	5925	5930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427705470
106	NC_019676	T	6	6	5989	5994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019676	TC	3	6	6005	6010	0 %	50 %	0 %	50 %	427705471
108	NC_019676	GTACG	2	10	6019	6028	20 %	20 %	40 %	20 %	427705471
109	NC_019676	ATG	3	9	6042	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705471
110	NC_019676	AGT	2	6	6087	6092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427705471
111	NC_019676	GGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427705471
112	NC_019676	ACTG	2	8	6205	6212	25 %	25 %	25 %	25 %	427705471
113	NC_019676	AAT	2	6	6224	6229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705471
114	NC_019676	CGC	2	6	6296	6301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427705471
115	NC_019676	A	6	6	6370	6375	100 %	0 %	0 %	0 %	427705471
116	NC_019676	AAT	2	6	6384	6389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705471
117	NC_019676	AATT	2	8	6427	6434	50 %	50 %	0 %	0 %	427705471
118	NC_019676	TAA	2	6	6451	6456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705471
119	NC_019676	ATTT	2	8	6472	6479	25 %	75 %	0 %	0 %	427705471
120	NC_019676	A	7	7	6498	6504	100 %	0 %	0 %	0 %	427705471
121	NC_019676	A	7	7	6642	6648	100 %	0 %	0 %	0 %	427705471
122	NC_019676	AATT	2	8	6673	6680	50 %	50 %	0 %	0 %	427705471
123	NC_019676	CCCA	2	8	6684	6691	25 %	0 %	0 %	75 %	427705471
124	NC_019676	GTAT	2	8	6704	6711	25 %	50 %	25 %	0 %	427705471
125	NC_019676	TGCT	2	8	6755	6762	0 %	50 %	25 %	25 %	427705471
126	NC_019676	CAAATC	2	12	6775	6786	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	427705471
127	NC_019676	GTT	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427705471
128	NC_019676	TGC	2	6	6845	6850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427705471
129	NC_019676	CAA	2	6	6862	6867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427705471
130	NC_019676	TTGTG	2	10	6869	6878	0 %	60 %	40 %	0 %	427705471
131	NC_019676	GA	4	8	6970	6977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019676	TGG	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427705472
133	NC_019676	CGAG	2	8	7078	7085	25 %	0 %	50 %	25 %	427705472
134	NC_019676	GTTA	2	8	7170	7177	25 %	50 %	25 %	0 %	427705472
135	NC_019676	TTC	2	6	7281	7286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427705472
136	NC_019676	TAA	2	6	7292	7297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427705472
137	NC_019676	TGT	2	6	7322	7327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427705472
138	NC_019676	CTG	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427705472
139	NC_019676	AGA	2	6	7371	7376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427705472
140	NC_019676	TCT	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427705472
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151	NC_019676	TGT	2	6	7980	7985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427705472
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154	NC_019676	AGT	2	6	8201	8206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019676	AATTT	2	10	8208	8217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019676	TAA	2	6	8223	8228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019676	A	6	6	8246	8251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019676	TAT	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_019676	TAA	2	6	13556	13561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_019676	AT	3	6	14589	14594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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353	NC_019676	TAA	2	6	17889	17894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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